ينطوي إجراء قناة الجذر على عدة خطوات. أولا، يقوم طبيب الأسنان بتخدير موضعي لتخدير السن والمنطقة المحيطة به، مما يضمن راحة المريض طوال فترة العلاج. يتم عمل فتحة دخول في تاج السن للوصول إلى حجرة اللب المصابة. تجري إزالة اللب المصاب أو الملتهب بعناية، وتنظيف الجزء الداخلي من السن وشكله باستخدام أدوات متخصصة. بعد عملية التنظيف، يتم تطهير الجزء الداخلي من السن للقضاء على أي بكتيريا متبقية. ثم يتم إغلاق المساحة التي يتركها اللب الذي تمت إزالته باستخدام مادة متوافقة حيويا لمنع العدوى في المستقبل. في كثير من الحالات، يتم وضع تاج الأسنان على الأسنان لاستعادة قوتها ووظيفتها.